故事的主人公，大山武进入了原本是女校的「天日学园」，在这间女性的花园的学校里，等著大山武的是可靠的青梅竹马兼学生会副会长的女主角天谷春恋、高傲的大小姐姫神木灵及非常可爱的未婚妻栉八稻穗。在天日学园中，除了有其他常规学校的课程外，学生还要学习使用及掌握「元素」，而当中有一部份学生更能够使用拥有不可思议力量的「魔具」……
这部《魔胎传》有两集，分别是上集《狂王復活への祈り》和下集《新宿摩天楼大戦 》。有些人说剧情不衔接之前三部曲这是事实，但其实这部的故事设定发生在之前三部曲之间，相当于是补了一作插叙，目的是为创造出“狂王”这个可以对抗超神的力量好让剧情得以延续下去。
去和比我更强的GIRL相见——。 “多边形”？那是啥？能吃吗？就在这种曾是2D全盛期的古早格斗游戏热潮到来的1991年。 在不良、阿宅、上班族蔓延的市郊游戏中心，她凛然地坐在那里——。 通过主人公春雄描绘的“90年代街机恋爱喜剧”！
未来的にデザインされた街・舞浜市に住み、近郊の高校に通う普通の学生、キョウ。たった1人で水泳部を切り盛りする彼は、中学の時の因縁から難癖をつけてくる宿敵らとのいざこざも意に介さず、水泳部への勧誘を行う傍ら練習に励むため学校の室内プールへと向かう毎日。 ある日、幼なじみのリョーコに頼まれ、映画研究部作品の撮影中、やる気の無いキョウはNGを出し撮影は中断。ふと、窓の外を見ると、プールの飛び込み台の最上段に1人の見知らぬ美少女・シズノが立っていた。 水泳部入部希望者と察したキョウは、慌ててプールへと急ぐが、シズノは声にならない謎の言葉を残し、華麗な飛び込みを見せ、そのまま水中に忽然と姿を消す。シズノの事が忘れられないキョウだったが、程無くして彼女はキョウの自室に忽然と現れた。 シズノはキョウに「ゲーム」の始まりを宣言した。キョウは彼女に導かれるままに異空間へ転送され、美しい光の装甲をまとった巨大ロボットゼーガペイン・アルティールに乗り込み、敵キャラクターをシズノと共に倒していく。だがしばらくして、キョウは様々な疑問に対峙していく事になる…。 繰り返されるデジャビュの感覚、自分しか知らない筈の事をいつの間にか知っているリョーコ達学友。キョウが真実に近づくのをどこか警戒している生徒会長=司令官シマ。ゼーガペインでの戦いを「ゲーム」と称した事で怒りを露にするルーシェン達パイロット。そして、初めて搭乗したゼーガペインの操縦桿を違和感なく繰る自分自身。 果たして、キョウが繰り広げるこの戦いは、本当にバーチャルなのだろうか? 様々な痛みと想いが交錯しながら、世界は徐々に真実の姿を曝け出し、遂に残酷な真実をキョウは目の当たりにする。 仮想世界と思っていた世界に広がる荒廃した舞浜…そこには破壊された学校やリョーコとの思い出の場所もあった。シズノは言った。ここが、現実の舞浜だと…。 そして、ゲームの敵と思っていた機動兵器の中には、アビス…深淵の名で呼ばれる亜人類の姿があった。 残酷すぎる事実と真実を知り始めた時、キョウの本当の戦いが始まる…!!
