《星学院Ⅲ之潘朵拉秘境》是“星学院”系列的第三部，主要讲述了菲洛、小月、美星三位魔法少女进入潘朵拉奇幻社就职的故事：菲洛和伙伴们通过在星学院的学习，成长为优秀的魔法师，并且即将面临毕业考核。然而这时，她们意外被卷入一场魔卡精灵的失踪事件。与此同时，瑞拉国王突然病重、潘朵拉魔卡风靡一时、王国大臣神秘消失，一切事件的背后似乎埋藏着十年前的一个惊天秘密。为了查明真相，菲洛和伙伴们加入潘朵拉奇幻社，成为极光组的一员。
“武”是指道义，“拳”并不是指拳头，而是握紧的希望！这个世界上所有人都在锤炼自身的能量“武魂”，以双手作为媒介而附上自身的灵魂，从而进行征战，这群人被取名为“武拳师”！这是一个关于武拳师英武向命运抗争，对抗邪恶的王道少年热血故事。
来自于地狱的邪恶之气侵入了荒蛮世界的生物啊啊啊，在一切万物被毁灭之前，一位神圣的猎人向邪恶势力射出了愤怒的子弹啊啊啊，但却更加激发了邪恶力量！这种势不可挡的邪恶力量侵蚀在荒蛮世界的生物体内并逐渐孕育成无坚不摧的魔鬼啊啊啊，当魔鬼遇见了抵抗却反而变得更加强大！人类遇到了来自魔鬼的毁灭力量， 这种毁灭力量汇聚在荒蛮帝国的神熊体内，燃烧在神熊体内的复仇之火在文明崩塌之前得以爆发！勇敢的莫日根猎人在生命最后一刻向魔鬼射出了最后一根神箭啊啊啊……
未来，人类对宇宙的探索进入了繁盛时代。机械师陈末本以为能搭乘星际飞船顺利达到人类开发的新世界——野原星。没想到一觉醒来，野原星成为一片焦土，而队友都变成了可怕的傀儡怪物。陈末并不知道，在休眠舱沉睡的几百年间，人类已经建立了星际联邦，野原星发生异变生灵涂炭。为什么我还活着？——怀着无数疑问，陈末修复了四名性格各异、功能不同的机器人助手，在他们的帮助下每天打怪求生、囤积物资，准备重返地球家园。然而一名从天而降的外星女人彻底打乱了他的归程计划，这位名叫克莱缇的美丽索恩贵族女爵，将倒霉的陈末带向了更大的麻烦之中……
