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　　这是一个人类理所当然拥有超能力“个性”的世界。被称为「笨久」的“无个性”少年·绿谷出久与憧憬的No.1英雄欧尔麦特相遇，被其发现绿谷隐藏的英雄资质，从欧尔麦特手中继承了“个性” One For All。笨久进入了英雄辈出的名门高中·雄英高中，以成为用“个性”拯救社会和人们的英雄为目标，和同学们一起度过了充满考验的每一天。 虽然打倒了宿敌All For One，但欧尔麦特也用尽了力量，便从职业英雄隐退。笨久继承了他的遗志，拿到了「职业英雄临时执照」，又接近了“最棒的英雄”一步。这时，笨久遇见了雄英三巨头中的一位，在职业英雄夜目爵士手下进行校外实习的三年级学生·通形未吏生。其压倒性的实力，让笨久更加向往在职业英雄事务所参加可以真正进行英雄活动的校外实习。另一边，不安分的＜Villain＞团体·死秽八斋会的年轻头领解修师，与继承了All For One意志的敌人＜Villain＞联军首领死柄木吊进行了接触。之后，在解修师的身旁，出现了一位少女的身影。 笨久与英雄候补生们即将与新的 “威胁” 进行战斗，新的 “使命” 挑战也开始了！！

拯救将近毁灭的世界不是一件简单的任务。因此，当城之内获得了四人的异国旅行的机会，游戏和他的朋友决定要珍惜这次难得的旅行，大概他们是这么认为的吧！在到达他们的目的地之前，他们的飞机失事，他们到了一个荒芜人烟的森林，遇见了神秘的 Dr. Alex Brisbane。Dr. Alex Brisbane惊奇地发现了，距离埃非常悠远的这个地方，有一个秘密的金字塔，通往另一个世界，胶囊怪兽的世界。                                                                      　　当游戏和他的朋友进入这个金字塔的时候，他们魔法传送到远古生物居住的危险王国，他们在一个神秘的迷宫中迷路,为了要找到通道回家,作了许多试验。                                                                      　　当游戏在生命危险的时候，他把的决斗盘换为 Capsule Shooter，一场生死决斗开始

　　他们拥有梦想。
　　总有一天，飞向广阔天空的梦想。
　　知晓被玻璃遮盖的这片天空有多么遥远。
　　遥远的未来。
　　人类在荒废的大地上建设了移动要塞都市“种植园”，并讴歌着文明。
　　在那当中建造的驾驶员居住设施“米斯特汀”，通称“鸟笼”。
　　孩子们就住在那里。
　　对外面的世界一无所知。
　　对自由的天空一无所知。
　　他们被告知的使命，只有战斗而已。
　　敌人是一切都被谜团覆盖的巨大生命体“叫龙”。
　　为了对抗尚未见过的敌人，孩子们乘上被称为“FRANXX”的机器人。
　　他们坚信，乘坐其中，就是对自己存在的证明。
　　有一位曾被称作神童的少年。
　　代号016。名字是广。
　　但他现在却跌落谷底。
　　是不被人需要的存在。
　　如果没有乘上FRANXX，就如同不存在一样。
　　在这样的广面前，某天，一位被称作02的神秘少女出现了。
　　她的额头，长着两根艳丽的角。
　　“——找到了哦，我的DARLING”