汉朝末年，董卓挟天子以令诸侯，战神吕布为其征讨，四方群雄并起。而大势决断，竟尽出一家之手，水镜门下八奇，谋冠天下。就在此时，一个神秘的刺客跟随他的商家主人悄然走进这个时代，牵出群英纷争，乱世无常……
在现实生活中只是平凡小孩的男主人公小特和女主人公小菲，在梦境世界里却是守护梦想的“超级英雄”。他们带着拥有特殊能力的梦精灵进入到孩子们的梦境中去，化身战士对抗想要扭曲孩子们梦境，获取恶梦力量的梦魔，阻止梦魔统治梦境，为孩子们守护快乐而美妙的梦想世界。该动画每集都会有孩子被梦魔魔拉的恶梦力量所影响，对自己的梦想失去信心，而主人公小特小菲就会在博士的帮助下进入孩子们的梦境，打败梦魔，重新获得梦想。正反派间的激烈对决，幽默搞笑的故事情节，让小朋友们在观看动画片的过程中能感受到正义、友爱、梦想的力量。
故事发生在1941年的中国，举国上下都顽强的抵抗着日寇的侵略，在平山团的英勇战斗中，日方节节败退。于是，狡猾的日寇将进攻的目标对准了平山团战士们的家乡——南滚龙村。王二小是生活在那里的一个平凡的小男孩，却有着满墙的热血和国人的胆识。敌人的到来让他失去了赖以生存的家园，他发誓一定要为死去的亲人们报仇。 一天，王二小在村子里遇到了受伤的日本士兵，士兵抓住了王二小，以性命相威胁命令王二小领他们去寻找藏在村子里的八路军。王二小表面顺从，实际上却带着日本人在村子里一遍一遍的兜圈子，与此同时，他的好友枣花则暗中通风报信。
古海在灵池内疗伤，被蛊虫迷惑心志，差点被控制的时候，小柔突然冲出来挡住蛊虫的侵蚀。被蛊虫报复的小柔遭遇到巨大的冲击，体内的能量突然爆发，灵力大散，小柔受了重伤。古海从幻境中醒来，发现受伤昏迷的小柔被蛊虫包围，立刻帮助小柔驱散蛊虫。感到心痛的古海决心一定要救活小柔，他不能再面对第二个为他而死的女人了。然后怜生大师为救POPO体力大失，也无法救助伤重的小柔。情急之下，只有抢蟠桃的办法了。于是四人小分队又面临与九公子大战的情境。结果，奕天阁发动了阻止蟠桃被抢的反攻，邪恶的蟠桃树散发出吸食人血的阴暗魔力，无数修仙者都丧命在去蟠桃的路上。古海一行人发现了蟠桃的机密，决心救助小柔后破坏这个邪恶的地方。在于九公子的大战中，三人接连受重伤，千钧一发之际，POPO爆发出了强大的能力，与九公子最终厮杀。然后在战事焦灼的时候，被小柔灵力吸引来的大明王神和陈太极一直在高处观战，他们也在伺机抢走蟠桃，而且他们想要的，也远远不止蟠桃那么简单…
超级飞侠第五季整体的基调充满活力与正能量。在延续前四季故事模式优点的同时，第五季还增添了以小爱、多多、米莉、包警长、小青为主的五个飞侠团队的新元素。本动画片故事内容以单元剧为主，在每一集中，拟人化飞机主角乐迪都会飞往世界各地不同的区域，为小朋友们递送他们所需要的包裹，因此观众们将跟随乐迪穿梭于世界各地，看超级飞侠团队运用各自团队的过人能力，帮助小朋友们解决困难。同时，本片中还会呈现世界各地的文化特色，如当地的常用语、当地有名的美食、名人趣事以及有趣的风俗习惯等。通过这部动画片，孩子们能够从中感受到快乐，拓展对世界各地文化的认识，并且学习到超级飞侠和小朋友们团结友爱、热情善良、互帮互助、一起成长的美好品质。
