神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
阿牛得到雷神托尔的神锤与火魔战斗，在朋友的帮助下战胜了火魔。接下来星猫一行人一起去狮王城寻找狮子座星座战士。阿杰进入狮王城打听到狮王城的国王白狮王和皇后神秘失踪，经过调查发现这一切都是狗头法师搞的鬼。马戏团里的小丑大牌竟然是失踪的狮王城王子？为什么白狮王和皇后被关在神秘的地牢？等等，关在地牢里的还有小吉和司令？ 乐观的两位小天使终于想起三弟从天神星发来的求救讯息，正当所有人为天神星发生的一切担心时，垃圾二人组之一的阿瑟叫醒了天神星十二判官，处刑人和执法官到底使用了什么秘密武器让天神星里被复制的魔化兵害怕？再次被吵醒的仙女姐姐看到蟑螂发生了什么？ 复制版的狗将军和太白老爹搭乘狗头战舰正赶往地球，星猫他们能化险为夷吗。
传说，骆武子助李斯修成秦始皇陵，被封为墓王。 后代弟子为皇亲贵族能人异士，修筑精巧奇墓，并派人世代守护。 其中有九座大墓被尊为墓王之王，号称千年不盗，万世不破。 威名响四海，富甲可敌国，江湖称其为墓王派。 骆武子死后，传墓王之位于大弟子慕容休，引得骆家子孙不满。 两大家族在天子面前约定，如破解九座奇墓，便可轮回墓王之位。 此后，骆氏族人离开墓王城，自立门户为攻墓派。 千百年来，两大门派，势同水火，攻守相持。 江湖上，又有邪魔盗匪垂涎奇墓宝藏，朝廷官府又欲染指墓王之位。 一时间，攻守盗捕，四大势力，风起云涌，杀机四伏，形成了一个惊心动魄的墓派武林。
乖乖女尹镰终于鼓起勇气向青梅竹马的宫风曜告白，却得到一个模棱两可的答复。是告白的时机不对，还是自己不够优秀？与闺蜜讨论一番之后，决定在开学典礼上进行第二次告白，却没想到另一场突如其来的高调告白将尹镰原本平静的生活彻底打破。典礼结束后，突然出现的巨大怪物让整座城市都陷入了毁灭的深渊。亲眼见到心爱的人死于怪物之手，尹镰还沉浸在伤心中时，司马长欢却出现在她的身边然后强吻了她，融合出了可以迫坏一切的地狱魔神！司马长欢想要夺回碎片，尹镰想要世界不被破坏，同时追到宫风曜。两人决定达成合作关系。而另一股势力——天国也在暗中观察着他们的一举一动，双方的战斗一触即发……
