喜羊羊及灰太狼等一众守护者们为了提升能力，进入深山密林进行特训，他们分别找到了传说中的两所训练营，羊狼们分别进入不同的训练营，开始了各自神奇奇术和炫酷发明的训练生涯。训练过程中笑料频出，大家克服重重困难学到了本领，也建立起深厚的友谊，两大阵营联手迎击来自未知世界的反派，开启羊村守护者全新的篇章。
故事延续第二季主线，灵界与斗魂卫在利益纠葛之下冲突不断，本季灵界派出强盛军队欲对斗魂卫赶尽杀绝，两方势力都在以正在举办门宗大会的五法山为中心汇集，在这里发生着惨烈的战斗与冲突。
故事，从一个“极速传说”开始…… 2009年，“雷速登闪电冲线” 世界遥控车大赛中，以“瞬间闪移”绝技闻名车坛的袁涛缺席，他最大的对手连一成为了新一届车神。但无法与袁涛在赛场上一决高下，成为了连一一生最大的遗憾。而袁涛，则成为了遥控赛车界一直被追逐的“极速传说”…… 三年后，连一的儿子，14岁的连城已经连续四届拿下遥控赛车全国冠军。虽然取得了成功，但是他跟父亲连一一样，一直希望可以打破袁涛所创造的“极速传说” 直到一天…… 袁涛的绝技“瞬间闪移”重现遥控赛车界，使出“瞬间闪移”的人，竟然是一个来自街区赛道的10岁小学生小熙！三年前决赛前夕，曾被袁涛所救的小熙多年来一直找寻着袁涛的踪迹…… 一心打破袁涛“极速传说”的连城与小熙不打不相识，也因此认识了小熙的好友，14岁的初中女生叶敏，身为机械天才的她，在遥控车改装方面有着过人的天赋。 为了成为真正的赛手，也为了寻找当年的“极速传说”，三人踏上了新一届“世界遥控车大赛”的征途，开始转战于全国各大城市。在北京、海南、成都等分站赛上，他们遇到了来自世界各地的选手。 连城的儿时好友宫本次郎擅长攻击，一部部战车毁在了他的手上，连城、小熙决意在赛场上让其醒悟。使用袁涛昔日战车的洪都拉充满谜团，实力不凡。而来自韩国的女赛手金成惠更给众人的友谊带来了前所未有的考验！ 世界大赛的路上，连城、小熙、叶敏经受着一次次严峻的挑战，也经历着一次次深刻的成长……
普通青年萧南烛回到家乡，意外继承了奶奶留下来的一本名为“乾坤历”的法宝和她曾经的职业——历师。通过乾坤历，一个个由传统节日化作的历神出现在他眼前：除夕、小年、元宵……驱除邪祟、维护人间，身为历师的萧南烛在了解到邪祟对人类的危害、 以及自己的职责后，选择与历神们携手，一同对抗各种邪祟。在与邪祟对抗的过程中，似乎有天大的阴谋逐渐出现，笼罩整个人间，萧南烛发现那个从一开始 便显得不同寻常的历神“除夕”身上，似乎有着不为人知的秘密……
即使这个世界如此丑陋，我们还是要一起活下去！
在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
