2033年，人类阻挡小行星撞击地球的计划失败了，人类灭亡了，而被遗忘在月球上的中等动物研究员独孤月幸运的活了下来，成为全宇宙最后一个人类。他开始锻炼身体、探索基地，不知不觉竟然将自己在月球上的孤独生活过出了乐趣。然而他不知道的是，基地摄像机将他的视频画面传回了地球，全球的幸存人类在地球上直播观看他的月球生活，并将他视为榜样。直到有一天，他发现自己没动过的蛋糕上有一个牙印.....难道月球上还有什么别的存在？
期末考结束后，零班成员除古月外在舞长空的提议下加入了唐门。回到东海城，零班加入新成员许小言，正式成立了以唐舞麟为首的四人团队。为了即将到来的天海联盟大比，舞长空对零班学员进行恶魔特训，正式开赛后，零班一路在个人赛和团体赛披荆斩棘，但在和双胞胎对战的过程中，唐舞麟古月深受重伤，零班不得不中途退赛。蛰伏三年后，零班学员在舞长空的带领下踏上前往史莱克学员的路程。
冷情总裁季尘风被“村姑”林莫冉失手砸失忆，意外成为他名义上的妻子，不料一场突如其来的火灾，两人失就此失联。再相见，他竟成了她的顶头上司，不仅几番解救她于危难之中，更是她逐梦星途的引路人，两人也由最初的契约关系，逐渐互生好感，感情渐浓，最终成就夫妻之实，甜蜜热恋。
在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
一年一度的春节即将到来，人们都陷入了一片欢快的节庆气氛之中。孤身一人在外的光头强（谭笑 配音）也想回家过年，只是李老板（张伟 配音）还拖欠着他的工资，光头强还期盼着能够用这笔钱给在老家的父母置办一点年货。最终，光头强找到了一份护林员的工作，和动物们一起保护森林的安全。 可是，李老板似乎是诚心要给光头强找麻烦，他派出了伐木机器人来到光头强守护的树林里大肆开采。为了履行自己的职责，光头强和熊大（张伟 配音）、熊二（张秉君 配音）、毛毛（孙尧东 配音）、涂涂（万丹青 配音）等可爱的动物们一起和李老板抗争到底。
