在本季《超级飞侠》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。 而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
蓝（雨婷儿 饰）的生日快到了，魔仙女王决定送给她一个非常珍贵的音乐盒。魔仙女王告诉小蓝，这个音乐盒里有一枚拥有强大魔力的宝石，这颗宝石能够在关键时刻帮助小蓝、美琪（赵今麦 饰）和美雪（刘黛希 饰）化险为夷。 哪知道，魔力宝石的秘密给邪恶的哈莱王后给知道了，哈莱王后非常 想要得到宝石，于是派出了自己的儿子奥玛。奥玛隐藏了真实身份，假装成一个平凡的普通人类接近小蓝一行人，在对方放松警惕后最终成功的夺走了宝石。哈莱王后利用宝石的力量开始向魔仙堡发起进攻，在魔仙堡腹背受敌的情况下，小蓝、美琪和美雪及时赶到，以正义的力量战胜了邪恶，维护了魔仙堡的和平。
云灵山太清门为苏若雪与刘飞举办双修大典之日，沈浪施展血灵九变变身翅展千米的雷鹏闯入并与众修士大战，覆灭云灵山宗门大半。面对陌生而熟悉的沈浪，失忆的苏若雪心神不定，平日脑海闪现过的画面也许真实存在过。让沈浪难以置信的是，他苦苦寻找多年的苏若雪不仅要嫁给这个四百多岁的修真老怪，而且一剑刺穿了自己的胸膛！沈浪拼命想要挽回苏若雪的记忆，在十年前，致力于研究虚拟现实的苏氏集团在林海天山峡谷中设立的研究基地—月轮爆炸，苏若雪重伤不省人事。间接导致这一幕发生的沈浪充满自责与愧疚，情急之下他把损坏仪器与苏若雪链接，陷入沉睡的苏若雪可以保命，但心神已神游月轮设置的太虚幻境，如若不尽早寻回，现实中的苏若雪将烟消云散。情急之下沈浪也链接仪器，进入到了太虚幻境中，开始了救回苏若雪的旅途。
魔晶学院近在咫尺，千瑞，御风和乌拉拉却被挡在了门外。失落的大家遇到了学长吉吉特，在吉吉特的帮助下，千瑞他们认识了绿色学院的长老天劫，还阴差阳错的获得了考试资格。大家一路过关斩将，顺利通过了五大长老严苛的考试，终于成为了魔晶学院的学生！然而当初答应天劫长老的要求，却让大家惹祸上身，一场大战在所难免。而魔晶学院16年前的秘密也逐渐被揭开。
巨兽时代来啦！这一季里，小咖率领咖宝勇闯恐龙时代破解时空错乱之谜，携手原始人拯救化石危机，雪山勇斗捣蛋小队守卫超级能源，带领动物大迁徙逃离生存危机，勇战狡猾的外星人保护地球和家人
