摩尔庄园第二季一直探寻的谜底即将揭开？！天才少年RK突破重重阻力，一暗自调查父母的下落，却意外地发现正义基因的秘密！超人乐乐侠的真正身份就是菩提大伯收养的孩子——摩乐乐！更不可思议的是，摩乐乐体内的正义基因源自一场失败的实验，而参加这场实验的首席研究员竟然就是自己的父母！乐乐侠的身份险遭曝光！
新的学年开始了，洛克和他的伙伴们努力学习，向最高难度的徽章发起挑战。然而，当洛克王国洛克和朋友们初次踏入幽暗空间时，却得知学院遭遇了空前的危机，播出由于时光扭曲，他们回到一个月之后的学院，此时学院已经完全沦陷，所有学生和老师都被恩佐控制。洛克和伙伴们想尽办法回到了原有的时空，找出的圣光羽石，粉碎了恩佐的阴谋，学院的危机被悄悄解除。
