数学荒岛历险记3是《荒岛历险记》数学系列的第三部作品，是一部凝合了数学科普教育与少年励志为创作主题的动画连续剧。故事承接了第一部和第二部的剧情。讲述了博士只做了3分钟“世界之王”，就立马被打回原形了。原来愿望之码一旦被激活，便可掌控自己的意愿，它告诉大家，要想获得真正的愿望，必须要比赛答题。答对1道数学题，可以实现1个3分钟的愿望，答对8道数学题，可以实现1个永久愿望。 由此，博士和罗克双方才开始真正的较量。国王、花花、依依、小强等荒岛伙伴能适应地球的新生活吗？罗克和UBIQ又会如何迎接新挑战，解除荒岛危机呢？而博士也拉拢了一个新帮手，博士经典的愚蠢阴谋功力会不会大增呢？摆脱各方控制的愿望之码，又将会有怎样令人称奇的表现？新危机，新挑战，新故事，一场全新的数学较量马上就要展开了。
故事讲述哈小浪平静的校园生活被一场突如其来的流星雨打破了，一颗流星居然正面砸中了许愿中的哈小浪，被流星击中的哈小浪不仅毫发无损，还升级了超能力。人们在砸落的流星中找到了一些星状徽章的物体，对它进行许愿便能立马实现愿望，许多人纷纷开始找更多的星状徽章。这些神秘的徽章也引来了外星生物，原来这些徽章一直都是外星生物追寻的宝物，为了收集齐这些星徽，外星生物大肆入侵哈小浪的星球。面对强大的外星生物，哈小浪和他的小伙伴们化身为“星城守护者”，为保卫星球之战奉献出自己的一份力量。获得星徽的星狗们便能利用它召唤出专属自己的的圣甲，而星徽要是落在了外星生物手中便会引起巨大灾难，双方也陷入了十二星徽争夺战中。
