本剧讲述超级飞侠与超级宠物们继续乘着迷你基地前往世界各地旅行，在旅行过程中邂逅世界各地的小朋友，并帮助小朋友们解决种种困难和问题的故事。如在山东潍坊，他们帮助小宝成功放飞了巨型章鱼风筝；在菲律宾，他们通过特制音响和扩音设备，帮助一个叫利娅的女孩达成了和鱼儿交朋友、一起唱歌的愿望。尽管遇到不少困难，但超级飞侠和超级宠物们每次都会用炫酷的装备和丰富想象力的办法，圆满地解决问题。
金阳原本是一个普通少年，有不少小毛病，但他有十分积极的心态、助人为乐的品格和不怕困难的勇气。一个偶然的机会，他参加了武当山太极学院夏令营，认识了年纪相仿的朱焰、蓝岳等人。校长静虚发给孩子们一些神奇的校徽，据说它与太极能量——元力息息相关。不料，此事被武当的千年对手影山得知。影山尊者发誓夺下武当山，派出手下不断刺探消息，骚扰攻击太极学院。金阳、蓝岳、朱焰等七位少年运用所学的知识，修炼的能量和“千年水滴”赋予的元力，与影山斗智斗勇，大家共同成长，逐步激发了内在的天赋，成为七彩“虹少年”。最终，他们和老师以及校长齐心合力，开启了真虹灵柱的能量，战胜了来犯的影山。
超级飞侠第五季整体的基调充满活力与正能量。在延续前四季故事模式优点的同时，第五季还增添了以小爱、多多、米莉、包警长、小青为主的五个飞侠团队的新元素。本动画片故事内容以单元剧为主，在每一集中，拟人化飞机主角乐迪都会飞往世界各地不同的区域，为小朋友们递送他们所需要的包裹，因此观众们将跟随乐迪穿梭于世界各地，看超级飞侠团队运用各自团队的过人能力，帮助小朋友们解决困难。同时，本片中还会呈现世界各地的文化特色，如当地的常用语、当地有名的美食、名人趣事以及有趣的风俗习惯等。通过这部动画片，孩子们能够从中感受到快乐，拓展对世界各地文化的认识，并且学习到超级飞侠和小朋友们团结友爱、热情善良、互帮互助、一起成长的美好品质。
熊猫一族，已在地球上生活了800万年，被世人称为“活化石”。传说，熊猫的祖先——熊猫大侠一身本领，锄强扶弱，为熊猫一族赢得了崇高地位，带领族人隐居于世外竹林，更在去世前耗尽心血布下无人能破解的八卦熊猫阵抵御外敌。 哈比，众多熊猫中的一只，平生最爱三件事——爱吃、爱耍宝、爱扮大侠！最大的梦想就是变成自己最崇拜的熊猫大侠。然而，面对其他熊猫小伙伴的嘲笑、巾帼女熊猫茜茜的日益强大、护族长老的偏心，让哈比“大侠梦碎”一气之下偷了秘籍跑进森林，以熊猫大侠的名义招摇过市，还真让自己成为了“闹翻天”组合等动物心目中的偶像。 自信爆棚的哈比却没意识到危险正渐渐靠近。森林第一“马屁精”赤狐垂涎于熊猫这“动物中的唐僧肉”，鼓吹森林之王雪豹捕猎熊猫。头脑简单四肢发达的雪豹屡次袭击哈比，更破解了“八卦熊猫阵”入侵世外竹林。眼看熊猫一族的灭顶之灾就要到来，哈比决定发奋图强，成为真正的熊猫大侠拯救族人，完成光复熊猫一族的伟大使命......
