问题儿童都来自异世界?

　　大资本家的千金美津子（平野绫 配音）父母双亡，被叔叔一家收养。在叔叔家的生活令美津子深感压抑绝望，因为她知道，他们一直都觊觎着她所继承的巨额财产，希望她尽早死去，为此甚至不惜使出了投毒的卑鄙手段。某天，一个自称二十面相（内田夕夜 配音）的男子出现在了美津子的面前，他告诉美津子自己是一名侠盗，并且邀请美津子加入他的世界和他一起去冒险，美津子毫不犹豫的答应了。
　　在新的世界里，美津子结识了各种各样二十面相的伙伴，然而奇怪的事情也开始逐件发生，在解开这些事件真相的同时，美津子发现，许多的疑点都指向了“二十面相的遗产”的谜团。同时，一些不知名的危险也在逐渐接近二十面相。

　　“瞒着妻子……会害怕吗？ ” 　　礼司和妻子、亲友夫妇一起访问了旅馆4天3夜。 　　明明是以和妻子生孩子为目的的，却被喝醉了的人妻（青梅竹马）从房间里带走了…… 　　而且本应是贞淑的妻子，在拉门的对面，对挚友……。 　　在本应该是夫妇一起睡觉的被子里，和别的对象依偎在一起的4人 　　沉溺于被禁止的“夫妇联欢旅行”——

　　拥有大量资产的神户家少爷大助前往赴任之处，
　　是仅会接收在警视厅引发问题之人的
　　「现代犯罪对策本部准备室」，通称「现对本部」。
　　大助在那里与重视人情的男人·加藤春组成了搭档。
　　面对连人命都以价钱衡量的大助，加藤以「世上并非只有金钱」加以反驳。
　　而各种各样的事件和谜团，阻挡在这对立的2人面前。
　　超越常识的搜查现在开始——！

　　缅因猫兽的暴走，以及由此引发的重启。 　　留下苦恼的芽心，太一等人前往数码世界。 　　重逢的搭档数码宝贝们，失去了至今为止的全部记忆。 　　即使如此也为了再次筑起羁绊，而伸出手去的被选召的孩子们，与回应此的数码宝贝们。 　　但，唯有比丘兽即使进化为成长期，也依然表现出警戒…… 　　“所以说过去的事情我不知道啦！” 　　面对比起自己更加优先关心他人的空的好意，比丘兽反而抱持着不信任感。 　　对于因受伤而久久伫立的空，太一和大和找不到能对她说的话语。 　　接下来，应该在数码世界做些什么才好—— 　　在商谈此事的众人面前，缅因猫兽突然现身，之后又消失了。他不知为何残留着原先的记忆，寻找着芽心，含泪彷徨着—— 　　看到这副景象，孩子们为了拯救缅因猫兽而对数码世界之旅下定了决心。但，他们的面前却出现了那个驱使黑暗四天王的男人的身影。 　　此时，现实世界的西岛收到了姬川失踪的报告。 　　调查此事的他，查出了姬川至今为止的行动背后隐藏着某个目的。 　　此事还关联着决定了两人命运的过去的某件事……

主角华园光的学校超精英贵族学校“私立白选馆学园高校”。 在这个有点奇怪的学校中，学生们被按照成绩好坏的顺序分到A到F的各级别中。全年级成绩最优秀的7名学生会进入"Special A"（或叫作"S·A"），这些“精英中的精英”享受特别的待遇。不仅制服和别的学生不同，并且可以在被称为乐园的温室中自修温习。所以学生们都很憧憬Special A级的学生。次一级的A级的学生也只有14名，A级的学生则是进入S·A的候补人选，只要他们的成绩能够超过S·A成员的话，他们就会入选S·A（相对的，也会有S·A成员被降入A级）。