门派废徒叶辰，被赶出宗门，无以为家，机缘巧合之下偶得真火，再踏仙武之路。 这是一个神魔仙佛并立的世界，这是一个诸天万域混乱的年代，叶辰的逆天征途，由此开始，历经磨难和轮回，最终问鼎大道巅峰。
11000年前，宇宙高等文明德诺文明爆发内战，烈阳星主神太阳之光毁灭了德诺星系。诺星上将杜卡奥携带德诺星系的神河超级战士基因来到银河系地球。 公元2017年，烈阳星太阳之光蕾娜来到处于核前时代的银河系地球文明，同时隐藏于地球上的神河基因得到了激活，率先觉醒基因的是划破虚空的银河之力和弑神之力诺星战神。与此同时，监视地球神河基因许久的三个集团，天使集团、恶魔集团、超神学院各自行动。华夏超神学院率先迅速行动将分散于地球的神河超级战士聚在超神学院，取名代号——雄兵连，由太阳之光蕾娜担任队长指导战士们进行先进的尖端对抗战术学习。 恶魔女王莫甘娜化名凉冰来到地球暗中传播堕落自由主义，谋划着如何消灭神圣凯莎。 天使集团派出左翼护卫彦为首的代表前往地球，而天使彦告知，冥河文明饕餮先头部队已直逼地球。 同时，天使集团、恶魔集团的行动渐渐浮出了水面……
一群来自上海市的孩子们到美丽的新疆参加暑期夏令营，被一个疯癫男子运用降魔圈带入到神奇的魔兽时代，原来，在未来的2090年，地球将会被魔兽统治，要想改变这一结局，疯癫男子必须在现在的时间里找到能够打败魔兽的圣使，而这个圣使就在这群孩子里。童未未就是那个圣使。这群孩子们和当地的孩子们一起，穿梭于时空中，和不同年代不同地点的人们沟通接触，在野人部落里救治了患病的小孩，在神奇的楼兰打败了凶猛的魔兽，通过一次次魔蛋的战斗，收复魔兽，运用智慧和魔兽使者周旋，最终，魔界使者告诉孩子们，毁灭地球的不是魔兽，而是人类的自私和贪欲，地球能源消耗过度，人类好战和自相残杀，只有人类找到人类最纯真的爱的力量。
这个世界是存在异人的。 张楚岚就是一个隐藏在普通人中的异人。在生命的前19年中，他一直小心隐藏着自己和别人的不同。直到有一天，神秘少女冯宝宝找上了他。从此他被活尸追，被怪人砍，被卷入了前所未见的麻烦之中……
牧尘，北灵境中史无前例取得“灵路”资格的少年。本应顺利通过“灵路”的试验后进入五大院学习，却史无前例地在灵路试炼中半途被踢了出来，没有人知道原因为何，许多人因此认为他不过是侥幸得到资格。然而牧尘将用实力证明，就算没能在“灵路”中走到最后，他也能夺取五大院的入门资格。
特别篇动画《秦时明月之罗生堂下》是独立于动画《秦时明月》正传剧情之外的短篇番外故事。该动画讲述少司命年纪轻轻就从阴阳家弟子成为了阴阳家五大长老之一的经历。
