Rewrite2

凛、黑、美美终于升上4年级。在决定班长时，全班同学都推举由美美担任，而凛却自荐自己。美美觉得凛是为了她才这样做的，而凛却说是“为了自己”……
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第0话为漫画单行本第6卷限定版同捆DVD

　　1989年，日本。                                    
                               　　乔纳森·乔斯达与DIO决战后的一百年，DIO复活了。同时，乔瑟夫的孙子，空条承太郎发现自己有幽波纹（替身）能力，DIO的复活影响了没有替身抵抗能力的母亲，陷入病危情况；为了拯救命在旦夕的母亲，承太郎与乔瑟夫出发前往DIO的所在地——埃及。                         

中学で失恋100回を達成した愛城恋太郎は、 中学で失恋100回を達成した愛城恋太郎は、高校でこそ彼女を！と願い訪れた神社で、現れた恋の神様から「高校で出会う運命の人は100人いる」と告げられる。しかし神様いわく、運命の人と出会った人間は、その相手と愛し合って幸せになれなければ死んでしまうという……。次々に待ち受ける運命の人との出会い──どうする恋太郎？どうなる100人の彼女！？

春日（植田慎一郎 配音）是一个标准的文学青年，成日埋头于书本之间的他将法国著名诗人波德莱尔的代表作《恶之花》奉为圣经。在春日的内心里，同班女生佐伯奈奈子（日笠阳子 配音）就是女神的象征，无奈于自己的平凡，春日只能依靠灼热的目光来传递心中的感情。 一次意外中，春日拾得了佐伯的体操服，鬼使神差之下他将还留有佐伯体香的体操服纳入了囊中，没想到，这一举动被班级里的“不良少女”仲村佐和（伊濑茉莉也 配音）完完全全的看在了眼里，而当春日想将体操服归还给佐伯之时他才发现，事态已经发展到了无法挽回的地步。利用春日的“弱点”，仲村和春日签订了所谓的“契约”，作为保守秘密的代价，春日不可以忤逆仲村的任何要求。恶之花静静的绽放，控制与被控制，一场三人之间的扭曲爱恋拉开了帷幕。

　　2000年，一个科学探险队在南极洲针对被称作“第一使徒”亚当的“光之巨人”进行探险。在对其进行接触实验时，“光之巨人”自毁，从而发生了“第二次冲击”，进而导致世界大战。最后，人类人口减半，地轴偏转、气候改变。根据对“第二次冲击”的调查，联合国在日本箱根成立人工进化研究所（即 GEHIRN）从事EVA（指机器人）的发展研究，后GEHIRN利用在人工进化研究所下方发现的巨大空洞建造了总部。 　　另一方面，联合国下属秘密组织SEELE为了使人类进化，开始实行人类补完计划，就是将所有人的灵魂汇集在一起，通过中和每个人的AT力场，使每个人回归LCL之海。 　　2004年，EVA初号机进行启动试验时发生事故，碇真嗣的母亲碇唯消失，碇源渡开始执行“碇源渡版本的人类补完计划”。2010年，GEHIRN被改建成NERV。 　　2015年开始，根据SEELE人类补完计划剧本的安排，一种巨型人形生物“使徒”开始在日本登陆，并向NERV总部进攻，NERV组织EVA消灭使徒。在NERV与使徒作战的同时，碇源渡秘密地执行它自己的计划。随着时间推移，碇源渡的计划逐渐被SEELE发现，NERV与SEELE产生了矛盾并不断恶化。 Director's Cut版本的第21～24集由剧场版《Death》篇剪辑而成，收录在20周年纪念版的蓝光中。