这是《福音战士新剧场版》的第四部，也是最终版。美里以及她的反 NERV 组织 Wille 来到巴黎，这里被核心染成红色，奇迹号战舰的船员降落在安全塔上，他们只有720秒能修复这个城市。 NERV的福音战士群出现时，真理的EVA改八号机进行拦截。与此同时，真嗣、明日香和绫波丽（暂定名）在日本的土地上徘徊。
南葛中と東邦学園の同時優勝で幕を閉じた全国中学生サッカー大会。 大会後、フランス・パリで開催される国際ジュニアユース大会に向け、 日本ジュニアユース代表が選出されることとなった。 世界への飛躍を誓う翼に加え、日向、若島津、そして若林、岬の海外組ら最強の布陣。 一方、日本を実力で上回る世界のサッカー大国も動き出していた。 ドイツのシュナイダー、フランスのピエール、アルゼンチンのディアス、イタリアのヘルナンデスら、新たなライバルたちもまた世界一の座を手中に収めるべくパリに集結。 夢と誇りを懸けた激闘が今、始まるのだった!!
在火星发现的神秘箱子――“潘多拉魔盒”打开的瞬间，巨大的墙壁突然出现！故事由此开始。被称为“天空之墙”的墙壁把日本列岛分割为三部分，并由此诞生了各自的首都「东都」「西都」「北都」。 其中在“东都”有被称为Smash的未确认生命体出现并暗中把人类逼入绝境。挡在Smash面前而出现的，是一位青年，其腰上戴着腰带、 手上握着不可思议的瓶子 。「变身！」―― 青年天才物理学者变身为假面骑士Build，阻挡在Smash的面前！
七耀历1205年。 在塞姆利亚大陆西北部最贫困地区出生长大的少女——拉薇。 为了保护自己的家乡，同时也为了证明自己与曾被尊为英雄 并背叛了诺森比亚的祖父弗拉德不同，她自愿加入了号称大陆最大的猎兵团——《北方猎兵》。 沉浸在自己的使命中而屡次违纪的拉薇，在某一天， 与马蒂、伊赛莉亚和塔利昂组成小队，并奉命前往埃雷波尼亚帝国执行一项鲁莽的间谍任务。 为了获得威胁诺森比亚的未知存在——“帝国的英雄”的情报。
米夏（白石晴香 配音）是有着一头金发的俄罗斯少女，幼年时，她的母亲因为车祸不幸早早的离开了她，米夏和父亲过着相依为命的生活。为了能够更好的照料米夏，父亲找来了许多的保姆，但是米夏真正希望得到的，是再也无法得到的母爱，因此常常将悲伤和愤怒发泄在这些保姆们身上，导致没有一个保姆能够在米夏身边久留。 这一次父亲找来的新保姆名叫鸭居燕（沼仓爱美 配音），米夏本以为自己可以故技重施再次作走这个女人，没想到鸭居燕和从前那些手无缚鸡之力的姑娘们不一样，她曾是日本航空自卫队的一等空曹。就这样，米夏和鸭居燕斗智斗勇的日常就这样展开了。
大切な妹を守り統ける兄、長谷川現。純粋なまでに兄を慕う妹、長谷川夢.過酷な現実の中で、互いに寄 り添って生活をしたきニ人だったが、ある日、赤い蝶を見た夢は未知のウイルス「pupa」感染し異形の怪物 こ羽化、動物や人問を見境なく襲ってしまう. その事を知った現は「pupa」の秘密を知る研究者、マりアからウイルスの進行を抑える手段を聞き、自らの身体を生き餌として夢に棒げる事を決意するのだった…。
