阿尔蒂

——某处海边，有家古老的咖啡店 在那里......似乎存在着女神—— 因为吵架而离开的祖母留下来的咖啡店「Familia」， “既然满满都是赤字，还不如赶紧关门大吉好让改造成停车场吧。” 主人公——粕壁隼，时隔3年终于回到了老家 在那里讲述“奶奶的家族”的5位陌生可爱的女孩子的故事。 突然只剩内衣？全裸！？等等，到底谁才是非法入室的家伙！ 这儿是我的家！一定要把你赶走！ 伴随着糟糕的相遇，一段关于家庭与恋爱的故事逐渐拉开了帷幕。

　　即将废社的时濑高中筝曲社。来到只身一人的社长面前的是不良少年和他的朋友们，以及古筝的天才少女。各自各自的古筝之乐所编奏的青春学园物语——                        

　　一之濑海（齐藤壮马 配音）自幼就非常热爱钢琴这门乐器，是公认的天才钢琴少年。一次偶然中，海在森林里发现了一架废弃的钢琴，只有海能够通过这架钢琴演奏出美妙的音乐。这架特殊的钢琴锻炼了海的演奏技巧，让他获得了和常人比更多的经验。
　　阿字野壮介（诹访部顺一 配音）曾经也是一名天才钢琴师，然而，一场意外的车祸让他不得不告别了自己的职业生涯，对过去耿耿于怀的壮介成为了海的叔父，将自己未能完成的期望寄托在了他的身上。雨宫修平（花江夏树 配音）是海宿命般的对手，两人亦敌亦友，互相竞争，齐头并进。

　　在公元2015年，一个魔术尚存的最后时代之中。人理继续保障机关「Chaldea」，透过近未来观测镜「Sheba」突然发现人类即将在接下来的2016年中毁灭。为了针对异象及时空特异典进行解析及干涉，他们利用被统称为「Grand Order」的禁忌仪式，将术师灵子化之后送回过去，只为阻止人类历史就此中断。
　　被扭曲的冬木圣杯战争，Saber（阿尔托利亚·潘德拉贡）黑化并杀掉Caster以外的所有从者顺道灭了整个冬木后在大空洞等待Caster的来临。这次战争的Caster为库·丘林，他个人表示如果职阶是Lancer就能秒杀黑Saber，因为主角，玛修和奥尔嘉玛丽的介入，成功停止了这场疯狂的圣杯战争，但Saber和Caster双双消失意味着这场战争没有人获得圣杯。关卡最后消灭了奥尔嘉玛丽灵魂的雷夫加上这次战争的Saber也认识Grand Order，到底是…？

人理续存保障机构·迦勒底，对于仅凭魔术无法看见的世界，仅凭科学无法计算的世界进行观测，为了让已被证明会灭亡于2017年的人类史存续下去，日夜持续着活动。 人类灭亡的原因，是在历史上数个地点突然出现的“无法观测领域”——“特异点”。 迦勒底唯一残存的御主·藤丸立香，与亚从者玛修·基列莱特一同介入这些特异点的事象，从而执行将其解明或破坏的禁断仪式——“圣杯探索Grand Order”。 这一次新发现的是第七个特异点——纪元前2655年的古代美索不达米亚。由结束了不老不死灵草的探索的“天之楔·贤王吉尔伽美什”所统治，以繁荣而自豪的乌鲁克之地，在三柱女神及众多魔兽的蹂躏下面临灭亡的危机。以及，通过前往过去的时间旅行——“灵子转移”而到达乌鲁克之地的藤丸与玛修，所遇到的是阻挡住魔兽猛攻的要塞都市·绝对魔兽战线，以及人们那即使暴露于威胁之下仍然拼命求生的样子。袭来的诸神与魔兽。以及对其反抗的人类——。 这里是人与神分道扬镳，命运的时代。跨越了六个探索Order的两人——藤丸与玛修所挑战的最后一战开始了。