主角·山本大介在年幼时因飞机失事而流落南美的亚玛逊河流，但奇迹的是他能够靠自己一个人生活下去，更在森林中练就一身钢铁般的身躯。 但此时邪恶组织·基度想利用古代印加文明征服世界，为了对抗基度，古代印加文明的承继兼守护者巴哥长老对山本大介施手术，并于左臂殖入印加秘宝叽叽腕轮，将他改造而成的神秘战士蜥蜴改造人·假面骑士亚玛逊。大介之后回到日本欲查明自己身世，进而展开与入侵日本的十面鬼率领之基度组织对抗的命运。
为了夺取主人公等所在的宫国所持有的珍贵引擎，邻国开始了日益激烈的侵略。为了迎击敌国，宫国被迫将仪式用复座式飞行艇“Simoun”改造成了战斗用战舰。还需要未性别化的“巫女”被派遣担任驾驶员，于是，她们成为了被称为“coru”的战斗小队成员。 操纵“Simoun”的少数少女被称为了“Simoun·シヴュラ（西贝拉）”因为拥有着特殊能力，她们可以选择自己成为大人的时间。但是因为战争的爆发，她们的优秀才能不得不运用在“Simoun”的操作上，换句话说，她们被强迫保持在了“少女阶段”……
《JoJo的奇妙冒险OVA第一期》(1993年-1994年，共6话)是根据原作漫画第三部后半部分改编的动画作品，描述发生在埃及的战斗。另外，第二期OVA(2000年-2002年，共7话)改编的是原作漫画第三部前半部分的内容。 2007年5月25日发售的《JoJo的奇妙冒险 第3部 星尘斗士 DVD-BOX》(共13话)收录了OVA第一期和第二期的全部内容，并按故事发生的时间先后顺序，把OVA第一期安排为第8话到第13话。 OVA第一期在2007年DVD-BOX中的话数安排如下： 話数标题 発売日 Adventure 8「愚者」のイギーと「ゲブ神」のンドゥール -前編- 1993年11月19日（VHS、LD） 2002年8月23日（DVD） Adventure 9「愚者」のイギーと「ゲブ神」のンドゥール -後編- 1993年12月17日（VHS、LD） 2002年8月23日（DVD） Adventure 10ダービー・ザ・ギャンブラー 1994年7月21日（VHS、LD） 2002年9月20日（DVD） Adventure 11DIOの世界 -亜空の瘴気ヴァニラ・アイス- 1994年8月9日（VHS、LD） 2002年9月20日（DVD） Adventure 12DIOの世界 -花京院 結界の死闘- 1994年10月21日（VHS、LD） 2002年10月25日（DVD） Adventure 13DIOの世界 -さらば友よ- 1994年11月18日（VHS、LD） 2002年10月25日（DVD）
