只有神知道的世界

　　本作主人公冈部伦太郎（宫野真守 配音）是个患有严重中二病的大学生，自称为“凤凰院凶真”的他和伙伴们组成了“未来发明研究所”，在位于秋叶原的一个简陋实验室内进行各种古怪发明和调查。                                    
                               　　2010年7月28日这天，冈部和青梅竹马真由理（花泽香菜 配音）一同去了科学讲义会场，在那里，他们遇见了天才少女牧濑红莉栖（今井麻美 配音）。让人意想不到的事情发生了，冈部在会馆楼道内听到一声惨叫，他闻声而至，发现了倒在血泊中的牧濑。冈部用手机短信将这件事告诉好友桥田至，这个举动，让世界都颠覆了。实验室里那个所谓的“未来道具”，竟然真的可以左右世界的进程，冈部自此成了孤独的观测者。                                    
                               　　这一切都是命运石之门的选择。

忍びの里から抜け出したくノ一さとこは、                                    
                               　　街で行き倒れていたところを通りすがりの女子高生このはに救われる。                                    
                               　　だがそれも束の間、さとこは里からの追手に見つかってしまう。                                    
                               　　しかしそんな追手をあっさりと返り討ちにするこのは。                                    
                               　　…なんと彼女の正体は殺し屋だったのだ！                                    
                               　　世間知らずのくノ一と殺し屋女子高生の危ない共同生活がスタート！

　　直人（森川智之 配音）和直也（石田彰 配音）是雾原家的两兄弟。由于拥有不同与常人的超能力，两人从很小的时候起就与养父御厨恭二郎（中村秀利 配音）与世隔绝居的住在荒无人烟的森林深处。也多亏了直人的陪伴，能够解读人心的直也才得以在这个充满黑暗和邪恶的世界中继续生活下去。
　　御厨恭二郎的死解开了森林里的结界，毫无社会经验的兄弟两人流落到人心叵测的社会中区。要在这里生存，就得吃饭，想吃饭，就要先赚钱。因为自身的超能力，两人几番经历的惊险时刻，亏有神秘的少女双海翔子（渡边明乃 配音）出手相助才得以脱险。而就在两人渐渐适应社会生活的时候，他们发现，自己貌似被卷入了某个阴谋之中。

从人类开始开发宇宙开始进入A.C.（After Colony）纪年，在第一个宇宙殖民地L1完成后百年，地球统一政府对殖民地以武力实行高压统治。 在A.C.165宇宙住民对地球圈发起抗争，而在其中的调停者是非暴力非武装份子的希罗·維，并在各殖民地和地上展开演说推广其理想，但其在A.C.175遭到暗杀（其中一种说法为杀手是OZ前身的特务组织的成员），随后殖民地陷入混乱并遭到特务部队（后来的OZ前身）镇压。之后在地球上提倡和平主义的山克王国和其王室匹斯克拉福特家族也遭消灭。 A.C.195年强力反对地球统一政府强力支配的殖民地份子，对地球送入了五架高达，开始歼灭特务部队OZ的“流星作战”（Operation Meteor）。