魔法科高校的劣等生 来访者篇

　　森の民の少年ポポは、平和な森に異変が起きた原因を調べるため旅立った父ペレの帰りを待ちわびていた。しかし森の異変は、ポポの母ピアまで変えてしまう。父ならば、母を助ける手がかりが分かるかもしれない。ポポは父に託されたドングリ型のペンダント「守護者の証」を胸に、父を追って旅立つ。
　　旅の途中、ポポが持つ「守護者の証」を狙って、森の破滅を願うアダーと手下たちが、赤い目の甲虫を操りポポを襲撃するが、そのたびに何処からともなく巨大なカブトムシ「ムシキング」が現れポポを護るのだった。

U.C.0153年，赞斯卡尔帝国大举进攻地球，并将反抗他们的人送上断头台公开处刑，这种残酷的手段激起公愤，神圣军事同盟的地下活动亦开始活发化。13岁的NEWTYPE少年胡索乃非法居住在地球上的众多居民之一，因为没有合法的居住权，所以他们往往在森林等隐蔽的地方居住。胡索与青梅竹马的夏克蒂以及其他一些孤儿在森林中安家，没有父母的他们一直过着平静的生活。然而，某一天赞斯卡尔帝国与神圣军事同盟在该森林中交战，胡索莫名其妙地被卷了进去，驾驶着V高达击退了敌人，自此这帮孩子的命运彻底地改变了。虽然不愿意，但已经无家可归的胡索他们加入了神圣军事同盟，与全部由女性组成的修克拉队共同行动，一次又一次击退了来犯的赞斯卡尔帝国军。取得地面上的胜利后，胡索他们又转战至宇宙，但是在一次交战中夏克蒂被敌人抓走了。原来夏克蒂乃玛莉娅女王的亲生女儿，荷塞想利用玛莉娅和夏克蒂的NEWTYPE能力，集合数万名超能力者的力量，通过天使之环的增幅器向地球发送超声波，令地球上所有的人类大脑死亡，从而达到他独霸地球圈的野心。最后，胡索驾驶着增强型的V2高达，开动光之翼并唤醒夏克蒂的力量，令天使之环分断开来，渐渐飞离地球回到各个卫星，赞斯卡尔帝国亦在光芒中崩溃殆尽……

在人类的心理状态和性格倾向都能被数值化的未来。所有的感情、欲望、社会病态心理倾向等全部被记录并管理，大众以“好的人生”作为目标，竭力于数值性地实现它。所有的监控摄像头都已经被升级和联网到一体，通过监视人类的色相浑浊程度和声音、视频等信息用来计算人类的每个心理状态和个性倾向所衡量的值，通称：（即片名：心理测量者PSYCHO-PASS），它被用作判定人们的思想应有PSYCHO-PASS状态、个人精神本身。通过计算这些数值，系统可以自主断定一个人最理想的工作，感情，心理压力，甚至犯罪意图。因此，为让大众达到“理想的人生”这个指标，人们实现这些数值就变得非常积极。然而，有关犯罪的数值，也就是“犯罪指数”也会被测量，当然犯罪者亦是如此。因此，人们需要不断地保证自己的指数在正常范围，否则会被系统认为是潜在犯，将会被"矫正"。而同在监视下维持治安的工作的刑警被分为抓捕犯人们的行动部队“执行官”、以及监视指挥执行官们的“监视官”一起合作执行任务。优秀的“执行官”自身就有着相当高的犯罪系数，从矫正设施挑选出来除了当执行官别无其他选择，但正是因为这样才能够接近犯罪根源。因为“执行官”也有着可能孕育成犯罪者的危险倾向，所以就需要对搜查行动有着冷静的判断力的精英“监视官”来监视。安全局刑事课第一分队的成员各怀想法，虽然发现自己的所作所为常常会与真正的正义相悖却不得不在监视下继续执行任务。同时在处理案件时正在一步步地发觉和探索管理人类这些数值的系统——Sibyl System的真面目。他们所面临的彼岸将会有着什么？

因为憧憬的前辈、摄影部部长牧之原的毕业，新任摄影部部长雨宫五月陷入了消沉。在朋友雾山杏的鼓励下，五月重新振作起来，购买了新的全景相机，却迟迟没有到货。发现卖家就在附近的五月和杏找到了学校附近的粗点心店，与漫画家秋山春乃相遇了。之后，摄影部与敷岛樱子的电影部合并，成为了“电影摄影研究部”（日语：シネフォト研究部），共同帮助春乃的漫画取材。