灰太狼费尽心思创造出各种发明来捉羊，却屡次失败。于是灰太狼来到发明星球，去抢宇宙级大发明家——妙多多发明的发明战车聚宝号来捉羊。慢羊羊得知后，准备造出另一个聚宝号对付灰太狼。但由于慢羊羊是普通发明家，不仅失败，还因此失去了发明能力。于是，小羊们也来到了发明星球。 一踏上发明星球，小羊们就被星球上不可思议的人和事所吸引：发明星球卧虎藏龙，居民都拥有自己专属的发明能力，是某一领域的发明高手。 小羊们通过新闻找到了妙多多，但聚宝号已经被灰太狼给抢走了。妙多多便给了小羊们他的另一辆发明战车——妙宝号来对抗灰太狼的聚宝号。由于聚宝号和妙宝号没有发明星球的能量来源——能量之芯，无法发挥最大功力。灰太狼便想尽各种办法，创造出各种发明来抢夺能量之芯。羊羊们便用妙宝号阻止灰太狼。妙多多还告诉小羊们只要妙宝号用发明帮助别人，积蓄能量，再配上能量之芯，可以使慢羊羊回复发明能力。于是，小羊们开始发挥奇思妙想，用发明解决居民们的花式求助。
一个善良的老爷爷种了一棵葫芦树，在他的悉心照顾下，葫芦藤很快结出了七颗大葫芦。葫芦们都很有灵性，老爷爷来了他们争先恐后的叫爷爷，老爷爷十分开心。然而一天，山里的蛇精将老爷爷捉走了，葫芦们看着十分着急，却也无能为力。随后，葫芦们一个个开始成熟了，一天，最大的那个葫芦掉在地上，一个葫芦娃从里面蹦了出来。他向兄弟们挥挥手，决定单枪匹马闯蛇洞去救出爷爷。他能成功吗？
娆疆一行归来，李嗣源已称监国，借天子之名四处绞杀不良人，而身为天子的李星云也即将面临一个新的选择……
神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
