这个星球上生活着不可思议的生物神奇宝贝。现在开始讲述少年小智和神奇宝贝们的相遇、冒险和战斗经历的故事。 在结束了在成都地区的旅行后 小智只带上了他最先获得的神奇宝贝——皮卡丘 来到了芳缘地方。但是在到芳缘地方的途中，皮卡丘被火箭队的攻击变得异常奇怪... 在AG中，小智和新加入的女主角——小遥，永远支持着小智的小刚，以及小遥的弟弟小胜，一起在芳缘地方，以及到对战开拓区旅行
“唉呀……过了25岁跟男人分手的话好难受啊！” 居住在北海道札幌，在浓汤咖喱店工作的鼓田美奈丽，在酒馆里与刚认识的当地广播局的导播·麻藤兼嗣谈起了自己的失恋经历。 第二天，就在她跟往常一样准备在工作岗位上开始工作时，店内播放的广播传来了美奈丽恶骂她前男友的声音……原来是麻藤将美奈丽的抱怨秘密录音了下来，并在广播直播中放了出来。美奈丽情绪激动地赶往了广播局。然而，麻藤却毫不畏惧地说了一句。 “小姐，既然你要停下来，那就说明你要负责主播喽？” 在这样的处境下，美奈丽为了辩解刚才的播放内容，拼尽全力地开始了自己的首次即兴直播。结果就是，这场广播出乎意料地大受好评，而后麻藤正式邀请她担任广播播音员。 “你，想不想主持一个冠名节目试试？”
人声鼎沸的赛场中，正在进行一场激烈的男女混合双打比赛。虽然结果早已内定，但是男组一方的面具男M意外击败女组。为了避免老板追杀，他和搭档落荒而逃，临行之际还不忘捎上心仪的对手S女士的玩具人偶。趁着夜色，他回到了从小生长的孤儿院。所谓孤儿院实际就是岌岌可危的破屋子，由好心的修女经营。面具男与孩子们快乐玩耍，同时见到了新来的美丽年轻修女。孤儿院愈加简陋，继续修缮，而丢掉工作的面具男却无计可施。就在此时，他接到老板打来的电话，原来S女士向他发起挑战，两人即将进行一场无规则大赛，获胜者将得到五千万日元的奖金。 为了给孩子们修房子，当然也为了见到梦寐以求的S女士，面具男M再度登上擂台……
