神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
辰南一行人离开东褚国，拜师入学神岚学院，协同梦可儿等人共同探寻邪道破灭道的真相，同时辰南自身的身世秘密逐渐浮出水面。
玉皇大帝就把谁都不愿意干的、整理天庭档案的工作交给了他们。几位成员没想到，天宫里所记录的档案是 “体验式”的，每一个管理员可以介入该档案所记录的事件回忆中进行体验。 于是，夺宝旅行团的一行人由此开始了一场场改写档案的新奇历险。
新的一年，全新好玩的故事在青青草原上演，这一次的主角是“好吃懒做”的懒羊羊（梁颖 配音），他将和好朋友与新伙伴们做出一道道美食，和小朋友们度过快乐美味的时光。 羊村建成了新厨房，村长（高全胜 配音）做出了很多好吃的姜饼分享给羊羊们。懒羊羊夜晚偷吃姜饼，无意间打翻了调味盒，谁知竟导致灶台下滋味王国的剧烈动荡。来自该王国的上学五宝棒棒、健健、康康、欢欢和乐乐要寻找跑走的姑奶奶（严彦子 配音），因为姑奶奶掌控着王国的各种滋味。麻烦的是姑奶奶住进了灰太狼（张琳 饰）的家，根本不打算回去。无奈之下，懒羊羊只能和伙伴们构思各种各样的美食，希望姑奶奶能够满意地回到她的国家……
传说，有一颗距离地球足有1000光年的星 球叫做奇轮星。在奇轮星上，住着数不清 的奇轮人。相传，这些奇轮人会不远千里 跑来地球，从所有爱玩奇轮射击的地球孩 子中寻找拍档。 而故事，就从一个叫烈焰的火族奇轮人选 定一个四年级小学生——李浩一作为拍档 之时全面展开……
五千年前，对于修行有着无数憧憬的少年，却因体质特殊而无法突破炼体期，进入下一个修炼境界。他从远古神话时代一直修炼到了现代社会，站在繁华都市中，炼体期九万九千四百四十二层的轩辕铭。给自己定了一个小目标：先修炼到炼体期十万层！
